傳說之始
從天地鴻濛初開之時，神州大地戰亂不止，於是天上諸神為了平息戰亂，鑄成了一把神兵利器「軒轅劍」。最後他們選定由人間靈氣最重、慧根最深的軒轅黃帝，來繼承軒轅劍以平定大地，於是軒轅劍的傳人軒轅黃帝手持軒轅劍，與窮凶極惡的魔頭蚩尤大戰，奮戰多時，終於將蚩尤打敗。但是蚩尤雖滅，其妖氣卻四洩八方，女媧神決定將大地清洗以根絕邪惡，再交由黃帝管理，但黃帝悲憫人們生活困苦仍遭洗覆，不惜犧牲性命來換取人間安定。
於是歷經千秋萬世，『軒轅劍』輾轉落入多位英雄豪傑手中，也造就了無數的光輝事蹟，不過邪惡仍舊隨時蠢蠢欲動。而今，軒轅劍的傳奇又將展開，這段傳奇，要從西方歐洲，一名叫賽特的男子說起……
（此為漫畫版劇情開頭，請勿與真正軒轅劍遊戲劇情混淆，兩者是不相干的）
劇情概要
西元七四九年，法蘭克王國騎士賽特奉執政首相丕平二世之命，前往東方尋找戰爭不敗之法，為了尋找帶路的阿拉伯人，他來到威尼斯城，希望能在這繁榮的貿易港遇到來交易的阿拉伯人。此時，威尼斯卻來了一群法蘭克的護教騎士團，他們將那些阿拉伯人當成異教徒給抓了起來，關進教堂之中，準備稍後給燒死。
為了執行任務，賽特決定潛入教堂將阿拉伯人救出，但是他死命戰勝擋路的獢，將阿拉伯人救出之後，一名詭異的老人卻以血的祭壇召喚出來自地獄的魔女─妮可。妮可不但纏著賽特，還說她是奉撒旦之命要來勸他加入撒旦陣營的，賽特被妮可纏的沒辦法，只好讓她繼續跟著。因為還有一部分的阿拉伯人已經被送上火刑場，賽特於是又趕往廣場救人，此時他發現，護教騎士團的帶頭者，竟是先前在路上碰到的麥爾斯…。
麥爾斯擔任護教騎士團的隊長，是法蘭克有名的勇士，他更是法蘭克第一美女莉蓮的情人；對於莉蓮傾慕已久的賽特，可說和麥爾斯是情敵。不過此時賽特為了救人的公事，還是與麥爾斯打了起來，雖然莉蓮出來阻止，卻被妮可無情的擊倒。不過為了趕緊處理任務，賽特還是設法脫身，來到了海洞，準備駕船出海。
此時在大陸的另一端∼中國，千年前軒轅劍俠何然所封印的惡神─巴蛇，突破封印逃了出來。巴蛇並與西方的魔王撒旦聯合，企圖一同征服天下，為了阻止巴蛇之野心，何然的仙魄再度現身，與巴蛇大戰，並運用元神將巴蛇困住。但這只能緩得一時急，仍必須找出軒轅劍最新的傳人，才能夠持軒轅劍將撒旦與巴蛇打倒。
因為建立大唐有功，而被封為天神的李靖，在天上見到巴神大亂人間，決定下凡助何然一臂之力，卻被天庭禁止下凡，而與眾神發生打鬥。寡不敵眾的李靖，雖有九天玄女的求情，還是被天庭懲罰，關入鎖神殿。
然而，邪惡的教士康那里士與修道院的大教皇（軒轅劍三只有修道院長，沒有大教皇這種東西…），企圖讓撒旦和巴蛇合作，決定讓麥爾斯心中潛伏的邪惡意識覺醒，並且要他阻止賽特前往東方。賽特解開了煉妖壺之謎後，動身前往修道院拿航海圖，並再度和麥爾斯大戰，妮可更召喚出火神姆斯比爾助陣，最後麥爾斯與康那里士只好撤退。
經歷了一連串的事件後，賽特來到了移動島上，並終於了解到自己真正的宿命，乃是軒轅劍的新一代傳人。妮可此時也決定背叛撒旦和賽特站在同一陣線，於是在印度精靈卡瑪的運作下，李靖與賽特會合，幾人一同協力，與魔王撒旦和惡神巴蛇對決……
（以上為漫畫版劇情概要，和真正的軒轅劍遊戲劇情有非常大的出入，請勿因此而混淆，將漫畫版劇情真的當作軒轅劍劇情）
漫畫畫面隨選 麥爾斯 賽特 何然 慧彥 妮可 李靖 卡瑪 九天玄女
購買管道
那麼，到哪裡可以買到軒轅劍的漫畫呢？當然發行之初，各大漫畫店或是部分書店都有賣，像站長就是在漫畫店買的。不過因為漫畫連載已經結束很久了，所以就和一些舊漫畫一樣，大部分都在店家消失了，所以想買也只能碰運氣問問看店家了。之前站長曾經有在二手書店之類的地方看過，不妨到這些地方去找二手的，應該會比較有機會。
如果想要收藏新的，目前來講已經很難了，不如到各大軒轅劍討論區詢問其他玩家，或是到相關的二手拍賣網站上看是否有人想拋售，目前拍賣網站上賣二手軒三漫畫的人不少。總之就是多問看看吧！要是不知該不該買，不妨先去漫畫出租店租來看看，開比較久的漫畫出租店應該都有，如果你覺得租來看就夠了沒必要再花錢去買，或想看看該不該買，那就去租吧！
港版與台版
另外，香港版和台版的又有什麼差別呢？首先，最大的差別是香港版有十八期，台灣卻只有九期，這只是合訂方式不一樣而已。軒轅劍漫畫為周刊，出了十八週，香港版的是把十八週分開賣，台灣版是雙週合訂本，所以兩週一期就只有九期。因此，有許多台灣的讀者看了後面作者的話覺得滿頭霧水（尤其香港的口語式中文已經很難懂了），哪來的第十、十一期啊？其實是指香港版而言。
其他的地方大致上就沒什麼差別了，只有封面、贈品和廣告不太一樣而已，台灣的封面只有九期，香港有十八期，然後左下角的價格和地區標誌不同、本期贈品字樣也不一樣之外，封面也幾乎無差別。
贈品
除了漫畫本身之外，和許多的台灣有的香港漫畫相同的是，軒轅劍漫畫也搭配漫畫本身，推出許多華麗的贈品。不過站長實在不是很有錢，光把標準版全買下來就已經快破產了，哪有錢去買什麼特別版？特別版雖然因為贈品比較高級所以貴上不少，不過有興趣的人還是可以去蒐集，其中第一期的贈品，相信很多去天之痕首賣會的人都已經有了。
雖然現在漫畫因為時代久遠已經買不到，不過如果大家對於這些附贈的小拆信刀有興趣的話，二手拍賣網站有時候仍然可以看到有玩家拋售，想收藏現在也都還來的及。
